"hajimete no oto" -> The line itself is a reference to Hajimete no Oto by malo, one of the first songs ever made featuring Hatsune Miku; the highlighted kanji (初) is the also the first kanji in Miku's last name but pronounced differently（00:02:52 - 00:03:24）
唱明者 / KAITO V3 - すこやか大聖堂【VOCALOIDオリジナル曲】

"rai-mei-" -> MEIKO

唱明者 / KAITO V3 - すこやか大聖堂【VOCALOIDオリジナル曲】

2023年04月19日　 @hoshiworks_aster 様　

00:01:26 - 00:02:16

MEIKO

唱明者 / KAITO V3 - すこやか大聖堂【VOCALOIDオリジナル曲】

2023年04月19日　 @tukimi-dango 様　

00:01:30 - 00:02:16

Unintentional bonus: "-kasane-ta" -> Kasane Teto, also an utterly insane coincidence considering Teto's set to make her official Crypton live debut on the BLOOMING tour with Mesmerizer (no I'm not kidding) and this song came out just over a year before Mesmerizer (though this is purely just me being delusional)

唱明者 / KAITO V3 - すこやか大聖堂【VOCALOIDオリジナル曲】

2023年04月19日　 @hoshiworks_aster 様　

00:01:42 - 00:03:24

KAITOってこんな透き通った高音出せるんや…

唱明者 / KAITO V3 - すこやか大聖堂【VOCALOIDオリジナル曲】

2023年04月19日　 @otanaooyaya 様　

00:01:46 - 00:03:24

"kagami" -> Kagamines

唱明者 / KAITO V3 - すこやか大聖堂【VOCALOIDオリジナル曲】

2023年04月19日　 @hoshiworks_aster 様　

00:02:16 - 00:02:25

リン、レン

唱明者 / KAITO V3 - すこやか大聖堂【VOCALOIDオリジナル曲】

2023年04月19日　 @tukimi-dango 様　

00:02:16 - 00:02:25

"-umi- wo -megu-ri" -> KAITO & Luka ("Megu"rine Luka)

唱明者 / KAITO V3 - すこやか大聖堂【VOCALOIDオリジナル曲】

2023年04月19日　 @hoshiworks_aster 様　

00:02:25 - 00:02:49

KAITO、ルカ

唱明者 / KAITO V3 - すこやか大聖堂【VOCALOIDオリジナル曲】

2023年04月19日　 @tukimi-dango 様　

00:02:25 - 00:02:51

I can only assume this is a reference to the fact for a while after KAITO's release people thought his last name was Shion (I joined the VOCALOID fandom in mid-2020 so you couldn't pay me to tell you why, but it's cute that it's here)

唱明者 / KAITO V3 - すこやか大聖堂【VOCALOIDオリジナル曲】

2023年04月19日　 @hoshiworks_aster 様　

00:02:49 - 00:02:52

Actually Miku is also

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2023年04月19日　 @InawaKomorebiTheKitsune 様　

00:02:50 - 00:03:24

～ ミク

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2023年04月19日　 @tukimi-dango 様　

00:02:51 - 00:03:24

"hajimete no oto" -> The line itself is a reference to Hajimete no Oto by malo, one of the first songs ever made featuring Hatsune Miku; the highlighted kanji (初) is the also the first kanji in Miku's last name but pronounced differently

唱明者 / KAITO V3 - すこやか大聖堂【VOCALOIDオリジナル曲】

2023年04月19日　 @hoshiworks_aster 様　

00:02:52 - 00:03:24